学术不端查重的方法主要包括利用查重软件进行文本比对、人工查重和参考文献查重。利用查重软件可以快速准确地检测出文本中的相似内容，人工查重则可以发现一些软件难以检测到的不端行为，而参考文献查重则能够检验文献引用的准确性和完整性。

另外，学术不端查重的方法还包括对文献中的数据和图片进行查重，以确保数据的真实性和图片的合法性。同时，学术不端查重也需要结合学科特点和研究领域的规范，采取相应的查重方法，确保学术研究的严肃性和可靠性。